Coscine

Download

coscine@lists.rwth-aachen.de

September 2023

1 participants
1 discussions

Events – Publikationen – API-Migration – Neue Dokumentation // Events – Publications – API-Migration – New Documentation
by news＠coscine.de 29 Sep '23

29 Sep '23

*** see english version below *** Liebe Coscine-Nutzende, nach einer zweimonatigen Sommerpausen freuen wir uns, Sie über die aktuellen Entwicklungen rund um Coscine zu informieren. Events Am 31. August 2023 hatten Teilnehmende des Young Academics Days während des MarketPlaces die Gelegenheit, sich über das Forschungsdatenmanagement an der RWTH Aachen University zu informieren und Fragen rund Coscine und die weiteren Infrastrukturangebote zu stellen. Wir bedanken uns für das rege Interesse und die interessanten Gespräche. Alle Eindrücke zum Young Academics Day haben wir für Sie auf dem FDM-Blog zusammengefasst (https://blog.rwth-aachen.de/forschungsdaten/2023/09/07/rueckblick-zum-rwth-…). Vom 12. bis 14. September 2023 fand erstmals die CoRDI Conference on Research Data Infrastructure initiiert durch den Verein Nationale Forschungsdateninfrastruktur (NFDI) e.V. statt. Am 13. September wurde Coscine vorgestellt und es bestand die Möglichkeit, offene Fragen zu stellen und Feedback zur Plattform zu hinterlassen. Den Nachbericht zur Konferenz können Sie auf dem FDM-Blog lesen (https://blog.rwth-aachen.de/forschungsdaten/2023/09/21/nachbericht-erste-co…). Im Rahmen des Best Practice Days am 19. September, veranstaltet durch fdm.nrw, wurde die Verwaltung von bakteriellen Genomdaten und Metadaten mit Coscine vorgestellt. Hierzu präsentierte Charlie Pauvert aus der Forschungsgruppe Funktionelles Mikrobiom am Institut für Medizinische Mikrobiologie des Universitätsklinikums der RWTH Aachen spannende Einblicke in die Verwaltung von Metadaten zu bakteriellen Genomdaten mit Hilfe von Coscine. Für detaillierte Informationen werfen Sie gerne einen Blick in den eingereichten Abstract (https://fdm-nrw.coscine.de/#/Veranstaltungen?id=best-practice-day-die-tools…). Während der NFDI4ing Konferenz vom 27. bis 28. September 2023, die unter dem Motto Innovation im Forschungsdatenmanagement für Ingenieurwissenschaften stattfand, wurde den ca. 35 Teilnehmenden die Möglichkeit geboten, am 27. September Einblicke in die Funktionen von Coscine zu erhalten. Die Vorstellung von Coscine fand im Rahmen des Nachmittagsprogramms unter dem Oberthema Tools for Research Data Management statt. Innerhalb von 30 Minuten gab es eine kurze Vorstellung von Coscine, gefolgt von einer Live-Demonstration und einer anschließenden Fragerunde. Besonders hervorzuheben ist an dieser Stelle die Verbindung zum sich gerade noch in der Entwicklung befindenden Tool "Jarves", mit welchem ein Projekt in Coscine angelegt wurde. In dem erstellten Projekt wurde während der anschließenden Live-Demonstration von Coscine eine Ressource angelegt. Dies gibt bereits einen Einblick darauf, dass in Zukunft noch viele weitere Features in Coscine sowie Verbindungen zu anderen Tools folgen werden. Im Allgemeinen förderte die Konferenz den Austausch über neue Praktiken im Forschungsdatenmanagement sowie die Stärkung interdisziplinärer Netzwerke. Falls Sie Interesse an dem Konferenzmaterial haben, können Sie sich dieses gerne in Ruhe anschauen (https://datashare.tu-dresden.de/s/xKZM8YewMQiNM4X). Um Nutzenden die bestmögliche Unterstützung für die Arbeit mit Coscine zu ermöglichen, finden im Oktober, November und Dezember jeweils Veranstaltungen zu verschiedenen Schwerpunkten statt. Im ersten Modul am 25. Oktober von 10-12 Uhr wird es eine allgemeine Vorstellung zu Coscine sowie eine Einführung in die Grundfunktionen der Plattform geben. Eine Anmeldung ist über die RWTH-Veranstaltungsdatenbank (https://www.rwth-aachen.de/cms/root/Die-RWTH/Karriere/Personalentwicklung-a…) möglich. RWTH-Externe bitte diesen Link verwenden (https://www.rwth-aachen.de/go/id/mkbr/file/5-53452/?lidx=1). An die Veranstaltungen im November und Dezember erinnern wir Sie gerne nochmals im nächsten Newsletter. Sie können die Termine aber bereits jetzt schon der Coscine Events Seite entnehmen (https://about.coscine.de/events/). Publikationen Sie möchten sich weiter in Coscine und die Wiederverwendbarkeit von Forschungsdaten einlesen? Dann verpassen Sie nicht das Paper "Research Data Reusability with Content-Based Recommender System" (https://scholar.google.com/citations?view_op=view_citation&hl=en&user=rP8O6…). Aktion erforderlich: API-Migration! Wie bereits in unserem letzten Newsletter angeteasert, wird es nun final: Die neue API-Version "APIv2" in Coscine kommt! Unsere Coscine-Entwickler*innen haben in den letzten Wochen fleißig daran gearbeitet, auf internen Testservern die Funktionalitäten getestet und nötige technische Anpassungen durchgeführt. Unsere Tests verliefen bezüglich der Stabilität positiv, da bereits alle Endpoints stabil laufen und lediglich kleine Änderungen noch offen sind. Die APIv2 ist einheitlicher und verständlicher und in unseren Test auch deutlich performanter. Die Live-Schaltung der APIv2 erfolgt voraussichtlich Anfang Oktober mit dem regulären Coscine-Update, welches i.d.R. alle zwei Wochen dienstags stattfindet. Da nächste Woche Dienstag, der 03. Oktober ein Feiertag ist, wird die Live-Schaltung der neuen API-Version deshalb vermutlich erst am Mittwoch stattfinden. Anschließend laufen beide API-Versionen für sechs Wochen nebeneinander, sodass eine problemlose Umstellung von Seiten der API-Nutzenden in Coscine erfolgen kann. Am 16. November 2023 wird die alte API-Version dann entfernt. Um einen reibungslosen Ablauf der Umstellung zu ermöglichen, haben wir auf der Coscine-Dokumentation eine Seite unter dem Namen "APIv2" (https://docs.coscine.de/de/api/apiv2/) eingefügt. Zu jedem EndPoint der neuen API-Version, zum Beispiel "Application Profile Controller" oder "Blob Controller" wurde bereits ein Issue in GitLab erstellt. Auf der Dokumentationsseite finden sich die entsprechenden Links zu allen erstellten Issues und weitere Informationen. Wir möchten uns deshalb bereits im Vorfeld dafür bedanken, dass Sie als Coscine-Nutzende zu einer Verbesserung der Plattform beitragen! Neue Dokumentation Die Dokumentation mit hilfreichen Anleitungen und hinreichenden Informationen über Coscine erstrahlt nun im neuen Glanz. Dank der Restrukturierung der Navigation und Anpassungen der Texte ist die Dokumentation nutzungsfreundlicher und es ist nun einfacher, bestimmte Anleitungen gezielt zu finden. Zudem haben wir eine neue Kategorie hinzugefügt: "FDM-Basics". Dort finden Sie einige Texte zu Grundthemen des FDMs. Klicken Sie sich gerne durch die einzelnen Seiten und bekommen einen detaillierten Einblick in die Funktionsweise von Coscine (https://docs.coscine.de/de/). Bei Fragen und Feedback freuen wir uns über Ihre Nachricht via servicedesk(a)rwth-aachen.de. Freundliche Grüße Ihr Coscine-Team *** english version *** Dear Coscine users, after a two-month summer break, we are pleased to inform you about the latest developments around Coscine. Events On August 31, 2023, during MarketPlace, participants of the Young Academics Day had the opportunity to learn more about research data management at RWTH Aachen University and ask questions around Coscine and the other infrastructure offerings. We thank you for the lively interest and the interesting conversations. We have summarized all impressions of the Young Academics Day for you on the RDM blog (https://blog.rwth-aachen.de/forschungsdaten/en/2023/09/07/rueckblick-zum-rw…). From September 12-14, 2023, the CoRDI - Conference on Research Data Infrastructure initiated by the association German National Research Data Infrastructure (NFDI) e.V. took place for the first time. On September 13, Coscine was presented and there was the opportunity to ask open questions and leave feedback on the platform. You can read the post conference report on the RDM blog (https://blog.rwth-aachen.de/forschungsdaten/en/2023/09/21/nachbericht-erste…). As part of the Best Practice Day on September 19, hosted by fdm.nrw, the management of bacterial genome data and metadata with Coscine was presented. For this, Charlie Pauvert from the Functional Microbiome Research Group at the Institute of Medical Microbiology of the University Clinic of RWTH Aachen presented exciting insights into the management of metadata on bacterial genomic data using Coscine. For detailed information, feel free to take a look at the submitted abstract (https://fdm-nrw.coscine.de/#/Veranstaltungen?id=best-practice-day-die-tools…). During the September 27-28, 2023 NFDI4ing conference, themed Innovation in Research Data Management for Engineering, approximately 35 attendees were offered the opportunity to gain insight into the features of Coscine on September 27. The presentation of Coscine took place during the afternoon program under the overall topic Tools for Research Data Management. Within 30 minutes, there was a short introduction of Coscine, followed by a live demonstration and a subsequent Q&A session. At this point, the connection to the tool "Jarves", which is still under development, should be emphasized. A project was created in Coscine with this tool. In the created project, a resource was created during the subsequent live demonstration of Coscine. This already gives a glimpse that many more features in Coscine as well as connections to other tools will follow in the future. In general, the conference promoted the exchange of new practices in research data management as well as the strengthening of interdisciplinary networks. If you are interested in the conference material, please feel free to have a look at it on Datashare (https://datashare.tu-dresden.de/s/xKZM8YewMQiNM4X). In order to provide users with the best possible support for their work with Coscine, events will be held in October, November and December on various topics. In the first module on October 25 from 10-12 am, a general introduction to Coscine as well as an introduction to the basic functions of the platform will be given. Registration is possible via the RWTH event database (https://www.rwth-aachen.de/cms/root/die-rwth/Karriere/Personalentwicklung-a…). RWTH external participants please use this link (https://www.rwth-aachen.de/go/id/mkbr/file/5-53452/?lidx=1). We will remind you again about the events in November and December in the next newsletter. However, you can already find the dates on the Coscine Events website (https://about.coscine.de/en/events/). Publications Want to read further into Coscine and research data reusability? Then don't miss the paper "Research Data Reusability with Content-Based Recommender System" (https://scholar.google.com/citations?view_op=view_citation&hl=en&user=rP8O6…). Action Required: API-Migration! As already announced in our last newsletter, it is now final: The new API version "APIv2" in Coscine is coming! Our Coscine developers have been working hard on it during the last weeks, testing the functionality on internal test servers and making necessary technical adjustments. Our tests were positive regarding stability, as already all endpoints are running stable and only small changes are still open. The APIv2 is more consistent and more versatile, and in our tests it also performs significantly better. The APIv2 will probably go live at the beginning of October with the regular Coscine update, which usually takes place every two weeks on Tuesdays. Since next week Tuesday, October 3, is a holiday, the new API version will probably go live on Wednesday. After that, both API versions will run side by side for 6 weeks, so that a smooth transition can be made by API users in Coscine. On November 16, 2023 the old API version will be removed. To enable a smooth transition, we have added a page on the Coscine documentation called "APIv2" (https://docs.coscine.de/de/api/apiv2/). For each EndPoint of the new API version, for example "Application Profile Controller" or "Blob Controller", an issue has already been created in GitLab. On the documentation website you can find the corresponding links to all created issues and further information. We would therefore like to thank you in advance for contributing to the improvement of the platform as Coscine users! New Documentation The documentation with helpful instructions and sufficient information about Coscine now shines in new splendor. Thanks to the restructuring of the navigation and adjustments to the texts, the documentation is more user-friendly and it is now easier to find specific guides. In addition, we have added a new category: "RDM Basics". There you will find some texts about basic topics of RDM. Feel free to click through the individual pages and get a detailed insight into how Coscine works. (https://docs.coscine.de/de/). If you have any questions or feedback, we look forward to hearing from you via servicedesk(a)rwth-aachen.de. Kind regards, Your Coscine Team -- IT Center RWTH Aachen University Seffenter Weg 23 52074 Aachen Tel: +49 241 80-24680 Fax: +49 241 80-22981 servicedesk(a)rwth-aachen.de www.coscine.de

1 0